米政府、IT企業共同体、新型コロナ研究でスパコンを活用

米国のトランプ大統領は、「アメリカのスーパーコンピューティングの力を解き放つ」新たな公共・民間共同コンソーシアムの立ち上げを発表しました。

ホワイトハウス、エネルギー省(DOE)、IBMがCovid-19ハイパフォーマンスコンピューティングコンソーシアムをリードし、Google、Amazon、Microsoftなどのハイテク企業が「さまざまなことに貢献している」と大統領はコメントしています。

長い道のり

「 スーパーコンピュータ は、このウイルスとの戦いにどのように役立つのか?このHPCシステムにより、研究者は疫学、バイオインフォマティクス、および分子モデリングで非常に多くの計算を実行できるようになるだろう。」 とIBMのリサーチディレクターのDario Gil氏はこのように述べています。

「この手の実験は、手作業で行うと数年かかり、低速の従来のコンピューティングプラットフォームで処理された場合には数か月かかります。」

エネルギー省のオークリッジ国立研究所にあるIBMのSummitスーパーコンピュータは、200ペタフロップスのパフォーマンスを誇ります。IBMは、疫学、バイオインフォマティクス、および分子モデリングなどのさまざまなプロジェクトで、多くの国立研究所および機関で合計330ペタフロップスの計算能力が利用可能である、と言います。

–オークリッジ国立研究所

米国核安全保障局は、その名前が示すように、通常は核兵器の研究にフォーカスしていますが、そのシステムの一部をCovid-19の研究に利用できるようにするとコメントしています。これには、23ペタフロップスの Lassen、3.2ペタフロップスのQuartz、1.8ペタフロップス grizzlyが含まれます。 125ペタフロップスのSierraは含まれていないようです。

NASA、米国国立科学財団、MIT、レンセラー工科大学、およびHPEも、大手クラウド系企業とともにコンソーシアムに対しサービスを提供します。

AWSは、Covid-19の研究をサポートするために、2,000万ドルのクラウドクレジットを発表しました。「HPCが大量のデータセットを処理し、複雑なシミュレーションを数日から数時間かけて実行するのにかかる時間を短縮できることはわかっている。」と、Google CloudのグローバルパブリックセクターVPのMike Daniels氏は言います。

「Covid-19の研究者が利用できるリソースを増やし、潜在的な治療とワクチンの開発にGoogleクラウドのコンピューティング機能を適用する事で、テクノロジー、学界、公共部門のリーダーと共にこのイニシアチブへ参加することを喜ばしく思う。」

Microsoft のAI for Health Program部門のグローバルヘッドのJohn Kahanm氏は、Azureクラウドサービスへのアクセスを拡大し、研究者に同社のデータサイエンティストとの協力機会を増やす、と述べました。

学界、政府、民間部門の研究者は、このコンソーシアムのウェブサイト上で新型コロナウイルス関連のプロジェクトを提出することができます。コンソーシアムのメンバーは、獣医アプリケーションの支援を行い、最もメリットがあると思われるアプリケーションを迅速に追跡します。

オークリッジ及びテネシー大学の研究者は、すでに有望と思われるCovid-19に関する調査でSummitを使用しています。そのスーパーコンピュータは8,000以上の化合物からシミュレーションを実行し、コロナウイルスの新たな治療法とワクチンの発見を促進するために利用可能な77の小分子を特定しました。

有意義な突破口が見つかるまでにはまだ時間がかかると予想され、それまでは自己隔離し、移動を最小限に抑えることが推奨されています。

Data Center Dynamics

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